Se presenta una lista de plantas registradas en la Reserva Biológica San Francisco, ubicada a 30 Km de la ciudad de Loja en el límite norte del Parque Nacional Podocarpus en la provincia de Zamora Chinchipe. Comprende cerca de 1000 ha de bosque montano bajo, bosque montano alto y páramo, en un rango altitudinal que va desde 1700 a 3200 m (Homeier & Werner 2008). Cada especie de la lista está enlazada con información de ejemplares de herbario conservados en el Herbario Nacional del Ecuador QCNE del Instituto Nacional de Biodiversidad y el Herbario LOJA de la Universidad Nacional de Loja.